A pesar de la gran extensión de área protegida y de su estatus como patrimoio mundial, el PILA no está libre de amenazas. Llas mayores amenazas al Parque son la cacería, la extracción de productos del bosque, el huaquerismo, las plantaciones ilegales y el avance de la frontera agrícola.
E l PILA se encuentra rodeado por las Reservas Indígenas Chirripó, Tayní, Telire y Talamanca de la Vertiente del Caribe; y por las Reservas Indígenas Ujarrás, Salitre y Cabagra de la Vertiente del Pacífico de la Cordillera de Talamanca. Uno de los objetivos del parque es contribuir con el desarrollo sostenible de la zona de influencia donde se localizan estas reservas indígenas.
La meta de este estudio fue entender mejor la interacción entre las poblaciones locales de la Reserva Indígena Talamanca Bribri-Cabécar y la biodiversidad faunística, así como el contexto social y económico dentro del cual se desarrolla esta interacción. La intención es proveer información base sobre la cual se pueden proponer acciones de manejo que no afecten el bienestar de la población
humana local ni la conservación de la biodiversidad.

Costa Rica ha comenzado hace varios años sus esfuerzos en la identificación de especies introducidas invasoras (vegetales y animales). También se ha trabajado en la identificación de impactos provocados por algunas especies invasoras, en particular el caso de los vertebrados en la Isla del Coco y su estrategia de erradicación.
Siguiendo en esta línea de acción y, dentro de un marco regional de diversas actividades de planificación entre las cuales figura la identificación de amenazas para la biodiversidad local, The Nature Conservancy abordó el tema de las especies introducidas invasoras o potencialmente invasoras en ciertas Áreas Silvestres Protegidas del Área de Conservación Osa (ACOSA).
Este estudio tiene el objetivo de generar información base para ACOSA con el fin de visibilizar, con respaldo científico, la relevancia de las especies invasoras para la conservación. Además, propone estrategias de manejo que ayuden a mitigar y/o eliminar esta amenaza en zonas vulnerables de ACOSA.

Esta publicación presenta el proceso de planificación marino costero del Área de Conservación Osa (ACOSA), ubicada en el Pacífico sur de Costa Rica. Este documento fue elaborado para The Nature Conservancy (TNC) en el Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR) de la Universidad de Costa Rica (UCR) con la participación activa de los actoresprincipales de ACOSA. El objetivo de este documento es servir de herramienta para la planificación y priorización de estrategias de conservación en esta región.

La Isla del Caño se encuentra sometida a fuentes de presión como el turismo, la pesca deportiva, pesca comercial ilegal y anclaje de todo tipo de lanchas y barcos, tanto de turismo como de pesca y camaroneros. Así mismo, la contaminación con líquidos y sólidos ocupa un lugar importante.
En esta publicación, se presenta un mapa batimétrico de la Isla del Caño, perfiles del fondo en varias direcciones perpendiculares a la isla, mapas de los hábitats marinos, listas de especies marinas, una lista con los trabajos científicos que se han publicado sobre organismos, ambientes y procesos marinos de la isla y se da una serie de recomendaciones para el manejo adecuado de los ambientes marinos.
El proyecto se enmarca dentro de las estrategias y actividades de conservación que realiza TNC en la región. La finalidad de estas evaluaciones es poder contar con una descripción clara y actualizada de los ambientes marinos costeros como herramientas de manejo y conservación.